2020年，国家林业和草原局批准设立第二批60个国家林业和草原长期科研基地（简称“长期科研基地”），由我院董胜君教授主持申报的“辽宁山杏种质资源保存与育种国家长期科研基地”为辽宁省唯一入选的科研基地。基地建设地点位于辽宁省朝阳市喀左县，建设面积1600亩，由我校牵头负责与喀左县共建。基地立足辽宁西部，面向我国三北地区，以野生杏属资源为研究对象，针对其种质资源保护与高效利用中的关键科学问题，重点开展野生种和近缘种的增补、收集、保存以及遗传多样性和重要性状评价，发掘重要性状基因，构建种质资源信息数据库，创制新种质，选育新品种，研发高效栽培技术，加速良种推广及科技成果转化。
基地具备完善的基础设施，配备监控及气象数据观测系统，自主研发的保存库信息系统可定位到所有种质的每个单株，涵盖了种质的生物学特性、生态学特性、生产特性及母树信息。基地建设了面积1300平米的科研办公楼，包括实验室、标本室、档案室、师生宿舍、食堂及管理用房等。同时设有沈阳农业大学研究生工作站、科研教学基地，为开展科学研究、技术开发、成果推广、科学普及、产业发展、产学研一体化建设及创新型人才培养提供了重要支撑。